Согласно последним лабораторным исследованиям, качество воды не соответствует требованиям санитарного законодательства по микробиологическим показателям в следующих водоемах:

 — р. Томь правый и левый берег в районе коммунального моста, р.Томь, речной вокзал, р. Нестоянка, озеро Песчаное, озеро п. Черная речка, озеро п. Кисловка, р. Бурундук (с. Борики), р. Обь (п. Победа)

 В р.Басандайка, р.Ушайка (п.Заварзино) качество воды отвечает санитарным нормам.

 Управление Роспотребнадзора по Томской области предупреждает, что купание на водоемах в местах официально не предназначенных для этих целей опасно для здоровья.