Рейтинговое агентство «Эксперт РА» опубликовало рейтинг вузов России, в котором СибГМУ по итогам 2014 года переместился на одну строчку вверх и занимает 30-е место в общем рейтинге и 3-е место – среди вузов медицинского профиля.
В тройке лучших медицинских вузов России СибГМУ уступил Первому Московскому государственному медицинскому университету им. И.М. Сеченова и Первому Санкт-Петербургскому государственному медицинскому университету им. академика И.П. Павлова.
В 2015 году СибГМУ впервые вошел в Национальный рейтинг университетов и занял там также третье место среди медицинских вузов России.