По данным национальной информационно-аналитической системы – Российского индекса научного цитирования (РИНЦ), томские университеты входят в топ-200 университетов России по индексу Хирша.
По данным на 14 октября в общероссийском рейтинге РИНЦ Томский государственный педагогический университет занимает 6-е место (индекс Хирша — 68). На 12-м месте находится Национальный исследовательский Томский государственный университет (индекс Хирша — 64), на 40-м — Национальный исследовательский Томский политехнический университет (индекс Хирша — 40). Сибирский государственный медицинский университет занимает в рейтинге РИНЦ 69-ю позицию (индекс Хирша — 30), ТГАСУ — 137-ю (22), ТУСУР — на 174-м месте с индексом в 19 единиц.