В модернизацию физической защиты Сибирского химического комбината с 2011 по 2013 годы вложено более одного миллиарда рублей, причем большая часть — привлеченные средства зарубежной технической помощи.
Ранее, в 2008 году, была завершена работа по комплексной модернизации физической защитыхимико-металлургического завода (ХМЗ) СХК. Особенность этой работы заключалась в том, что срок ее завершения был зафиксирован на уровне так называемых Братиславских соглашений президентов России и США. В этот же период на ХМЗ модернизировалась система учета и контроля ядерных материалов. Следом последовала модернизация систем безопасности реакторного завода и сублиматного завода СХК. На заводе разделения изотопов данные работы велись более пяти лет, с 2009 по 2014 год.
Кроме модернизации физической защиты заводов с 2005 по 2015 годы на СХК была значительно укреплена техническая оснащенность воинских частей, охраняющих объекты комбината и Северск. Реконструирован стрелковый тир, модернизировано открытое стрельбище в поселке Чернильщиково. Выполнен комплекс работ по укреплению рубежей на городской контролируемой зоне. В 2014 году установлены турникеты и защитные кабины на основных контрольно-пропускныхпунктах города.
Партнерами СХК, оказавшими серьезную материальную помощь, выступили зарубежные организации, среди них, в частности, МИД и Общество по безопасности реакторов и ядерных установок Германии, национальные лаборатории министерства энергетики США. Совместными усилиями системы безопасности СХК переведены на новый качественный уровень.